作为新冠防疫对策，主办方将对所有参加者实施PCR检测，呼吁在比赛开始前一直戴口罩。
据悉，组织方将要求重症化风险高的65岁以上人群不要参加，对被谢绝参赛的人返还报名费，并允许其下次参赛。
东京马拉松2020年3月大幅缩小规模举行了比赛，仅由顶尖选手参加。2021年的比赛从3月延期至10月，之后又推迟到今年3月。